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Campo DCValorIdioma
dc.contributor.advisor1Ferreira, Gustavo Portela-
dc.contributor.advisor1LattesNCpt_BR
dc.creatorAraújo, Paloma Maria de Sousa-
dc.creator.LattesNCpt_BR
dc.date.accessioned2023-04-18T12:54:11Z-
dc.date.available2023-04-18T12:54:11Z-
dc.date.issued2022-12-01-
dc.identifier.urihttp://dspace.ufdpar.edu.br:8080/jspui/handle/prefix/27-
dc.description.abstractNCpt_BR
dc.description.resumoOs arbovírus são um grupo de vírus transmitidos por vetores artrópodes hematófagos, pertencentes às famílias Togaviridae, Flaviviridae, Bunyaviridae, Rhabdoviridae e Reoviridae. No Brasil, o Chikungunya virus (CHIKV), tornou-se uma grande ameaça à saúde pública a partir do surto no biênio 2015-2016. A gravidade da infecção está associada à cronificação de artralgia debilitante presente entre 40-80% dos infectados. O West Nile virus (WNV), é responsável por mais de dezenas de milhares de casos notificados nas Américas, sendo 24.000 destes neuro-invasivos e mais de 2.300 óbitos. A circulação no Brasil foi detectada em áreas florestais e rurais, e em 2014 foi confirmado o primeiro paciente infectado por WNV no Piauí, com quadro clínico de encefalite aguda. Para se fazer a diferenciação laboratorial dos arbovírus, diversos métodos podem ser utilizados, como os sorológicos e moleculares. O diagnóstico molecular apresenta um resultado mais sensível e específico, e para esse grupo de doenças a técnica mais utilizada é a RT-PCR qualitativa e suas variantes, como o a RT-PCR quantitativa. O que garante a diferenciação entre as diferentes aplicações é a utilização de uma sequência alvo específica e os iniciadores. Para a obtenção de um resultado fidedigno, a construção dos iniciadores deve obedecer a algumas características. A partir do desenho e validação in silico, é possível utilizar iniciadores que fornecem maior especificidade e sensibilidade na amplificação do material genético dos arbovírus estudados. Os parâmetros para a construção dos iniciadores dos vírus estudados foram previamente estabelecidos, como tamanho dos iniciadores e do fragmento amplificado, temperatura de anelamento e conteúdo GC%, de acordo com os critérios definidos de cada técnica. O Geneious Prime® é uma ferramenta alternativa de fácil uso que realiza alinhamento de sequência, construção de iniciadores e análise de suas características. Este software indica os iniciadores, suas características básicas e possível formação de estruturas secundárias, sendo que essa análise consta como a primeira etapa para sua validação.Ao final da checagem, os iniciadores que atenderam aos parâmetros são submetidos à ferramenta UCSC In-Silico PCR, para pesquisa em banco de dados de sequências de outros organismos, a fim de avaliar possíveis anelamento com organismos que não são de interesse e que podem ser amplificados como contaminantes durante as técnicas moleculares. Em conjunto, a busca na literatura com o intuito de verificar o padrão de publicações realizadas acerca dos arbovírus em estudos in vitro e in silico, delimitada entre os anos de 2019, anterior a pandemia de SARS-CoV-2, até março de 2022. Considerando que os iniciadores construídos a partir das regiões nsP2 e nsP1 para CHIKV e regiões E e 3’UTR para WNV atenderam as características básicas e ideais de funcionamento adequado para as técnicas de RT-PCR e RT-qPCR, podemos sugerir a utilização na experimentação das técnicas moleculares. Em relação à produção científica, foi percebida discrepância entre os bancos de dados. Enquanto no ScienceDirect houve grande aumento nos estudos produzidos ao longo dos anos, de forma não homogênea (desvio padrão 18,5-85),no PubMed, a amostragem foi mais homogênea (desvio padrão 1,1-9,1), porém, com quantidade inferior de estudos.pt_BR
dc.description.provenanceSubmitted by Cátia Regina Furtado da Costa (catiarfc@ufpi.edu.br) on 2023-04-18T12:02:59Z No. of bitstreams: 2 CONSTRUÇÃO E VALIDAÇÃO.pdf: 1994338 bytes, checksum: 8e335545d7c0739ab70292a1c1aa2e18 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5)en
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dc.description.provenanceMade available in DSpace on 2023-04-18T12:54:11Z (GMT). No. of bitstreams: 2 CONSTRUÇÃO E VALIDAÇÃO.pdf: 1994338 bytes, checksum: 8e335545d7c0739ab70292a1c1aa2e18 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2022-12-01en
dc.languageporpt_BR
dc.publisherUniversidade Federal do Delta do Parnaíbapt_BR
dc.publisher.countryBrasilpt_BR
dc.publisher.departmentDepartamento 1pt_BR
dc.publisher.initialsUFDParpt_BR
dc.rightsAcesso Abertopt_BR
dc.subjectarbovirosespt_BR
dc.subjectvírus Chikungunya-
dc.subjectVírus do Oeste do Nilo-
dc.subjectin silico-
dc.subjectdiagnóstico molecular-
dc.subject.cnpqCNPQ::CIENCIAS DA SAUDEpt_BR
dc.titleConstrução e Validação In Silico de Iniciadores para Detecção Molecular dos Arbovírus Chikungunya Virus (chikv) e West Nile Virus (wnv) em Contexto de Pandemia do Sars-cov-2pt_BR
dc.typeTrabalho de Conclusão de Cursopt_BR
Aparece nas coleções:Bacharelado em Ciências Biomédicas

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